Horst kigger ud gennem det højtsiddende, tilgitrede vindue. Han kan kun se pigtråden på toppen af fængselsmurene og spiret af et vagttårn i Flensborgs fængsel. Han har siddet her længe og har flere års afsoning foran sig. Han tænker på sit liv. Han vil forstå, hvorfor alting er gået galt.
På et bagtæppe af tysk efterkrigstid, dens historie, kultur og levevilkår er Fængsler en roman om kærlighed, kaos og vanvid, der udfordrer grænsen mellem fakta og fiktion.
