1990. De CIA-støttede, hemmelige GLADIO ”stay-behind” grupper afsløres over hele Europa. Politikerne på venstrefløjen er rasende. Var de også i Danmark? Forsvarets Efterretningstjenestes arkiver er næsten tomme. Den pensionerede Kommandørkaptajn Jørgen Knudsen, tidligere afdelingsleder i FE, indkaldes til afhøring hos FE. Men fortæller han hele sandheden? Vi går tilbage i tiden.
1945. Krigen er forbi. Jørgen Knudsen har først været frihedskæmper, derefter i den hemmelige danske efterretningstjeneste i Stockholm. Men hvem er nu ven, og hvem fjende? Tilbage i Søværnets Efterretningssektion skal han snart finde ud af, at tyskerne kan blive til venner, og russerne og de danske kommunister til fjender. Tyskerne kan hjælpe genopretningen af den danske flåde med viden om ubåde og torpedoer. Et uformelt samarbejde med den spirende, hemmelige tyske efterretningstjeneste kommer i stand. Gang på gang sendes han til det sønderbombede Tyskland, men gang på gang underminerer Russerne vejen frem. Hvordan går det til?
Den engelske efterretningstjeneste MI6 holder øje med Jørgen Knudsen og hans møder med en yngre, dansk kvinde på diverse hoteller. Hans chef kan berolige MI6, kvinden er Kirsten Henriksen, underdirektør i et selskab, som tilhører Knudsens kone. Men chefen har sine særlige ideer om, hvad det kan føre til i forhold til den kommunistiske trussel.
1950. I et par år har efterretningstjenesten arbejdet med danske ”stay-behind” grupper, hvis Russerne skulle besætte landet, men nu siger en ny topchef fra. Det synes Jørgens chef og Jørgens yngre kollega Peter Larsen ikke om. Men de vil vel adlyde? Jørgen bliver sat på en umulig opgave, da hans chef opdager, at Russerne kender grupperne og deres skjulesteder. Jørgen, Peter og Kirsten mødes på en lille, øde havn ved Svanekes fyr for at finde en løsning.
1990. FE afslutter samtalerne med Jørgen Knudsen og skriver en kort rapport. Men hvem venter uden for porten? Nye afsløringer kommer frem under en frokost på Restaurant Lumskebugten.
