Klokken tre om morgenen slår Sikkerhedspolitiet til mod en række familier i en forstad til Stockholm. Næste dag eksploderer nyheden om, at “al-Qaeda i Sverige” er uskadeliggjort, og at landet er blevet reddet fra den største katastrofe nogensinde. Ni personer varetægtsfængsles som terrorister, men derefter udbryder den store tavshed. Ingen ved, hvad der sker i efterforskningen.
Politiinspektør Ewa Johnsén-Tanguy, der er ansat i bagmandspolitiet, får til sin overraskelse et nyt job, nemlig at lede afhøringerne af de terrormistænkte. Dermed havner hun og hendes venner, bl.a. journalisten Erik Ponti, på hver sin side i krigen mod terror.
FJENDEN I OS SELV gør op med de love, som siges at have til hensigt at beskytte demokratiet, men som i virkeligheden skader demokratiet betydeligt mere end terrorismen gør.