Historien om Indigobørnene begynder i London i året 1666. Pesten hærger i gaderne. I en lille kirke har en forseglet skriftrulle ligget gemt i århundreder. En skriftrulle, der indeholder sandheder, som mennesket endnu ikke er klar til at kende. Sandheder, som vil ryste verden i dens grundvold. Selv i dag.